Пакет: phast (1.6+dfsg-5)

Връзки за phast

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник phast.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [compgen.cshl.edu]

Подобни пакети:

phylogenetic analysis with space/time models

PHAST is a software package for comparative and evolutionary genomics. It consists of about half a dozen major programs, plus more than a dozen utilities for manipulating sequence alignments, phylogenetic trees, and genomic annotations. For the most part, PHAST focuses on two kinds of applications: the identification of novel functional elements, including protein-coding exons and evolutionarily conserved sequences; and statistical phylogenetic modeling, including estimation of model parameters, detection of signatures of selection, and reconstruction of ancestral sequences.

PHAST does not support phylogeny reconstruction or sequence alignment, and it is designed for use with DNA sequences only (see Comparison).

Други пакети, свързани с phast

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libblas3 [sparc64]

Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

или libblas.so.3

виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: liblapack3

Library of linear algebra routines 3 - shared version

или liblapack.so.3

виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

New Perl Compatible Regular Expression Library- 8 bit runtime files
dep: libtmglib3 (>= 3.12.0) [sparc64]

test matrix generators of LAPACK - shared version

Изтегляне на phast

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2 844,7 кБ	28 714,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2 984,2 кБ	25 002,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2 806,5 кБ	25 258,0 кБ	[списък на файловете]
armel	2 597,4 кБ	23 032,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	2 504,6 кБ	17 268,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	2 680,7 кБ	24 839,0 кБ	[списък на файловете]
i386	3 025,2 кБ	26 522,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	3 541,5 кБ	55 315,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	2 659,3 кБ	21 640,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2 846,9 кБ	29 000,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	3 149,7 кБ	32 749,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	3 164,8 кБ	31 213,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2 952,4 кБ	20 553,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2 826,5 кБ	27 878,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	2 570,1 кБ	21 586,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	2 792,9 кБ	38 773,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	2 971,8 кБ	24 820,0 кБ	[списък на файловете]