всички настройки
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Източник: kallisto  ]

Пакет: kallisto (0.48.0+dfsg-4 и други)

Връзки за kallisto

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник kallisto.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

near-optimal RNA-Seq quantification

Kallisto is a program for quantifying abundances of transcripts from RNA-Seq data, or more generally of target sequences using high-throughput sequencing reads. It is based on the novel idea of pseudoalignment for rapidly determining the compatibility of reads with targets, without the need for alignment. On benchmarks with standard RNA-Seq data, kallisto can quantify 30 million human reads in less than 3 minutes on a Mac desktop computer using only the read sequences and a transcriptome index that itself takes less than 10 minutes to build. Pseudoalignment of reads preserves the key information needed for quantification, and kallisto is therefore not only fast, but also as accurate than existing quantification tools. In fact, because the pseudoalignment procedure is robust to errors in the reads, in many benchmarks kallisto significantly outperforms existing tools.

Други пакети, свързани с kallisto

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на kallisto

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Версия Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 0.48.0+dfsg-4 262,0 кБ918,0 кБ [списък на файловете]
amd64 0.48.0+dfsg-4+b1 279,7 кБ805,0 кБ [списък на файловете]
arm64 0.48.0+dfsg-4+b1 241,5 кБ725,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 0.46.2+dfsg-3 238,2 кБ676,0 кБ [списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура) 0.48.0+dfsg-2 347,0 кБ1 520,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 0.46.2+dfsg-3 228,3 кБ656,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 0.48.0+dfsg-4+b3 239,4 кБ883,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 0.48.0+dfsg-4+b1 280,0 кБ981,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 0.48.0+dfsg-4+b1 284,1 кБ917,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 0.48.0+dfsg-4+b2 270,6 кБ625,0 кБ [списък на файловете]
s390x 0.48.0+dfsg-4+b1 280,6 кБ833,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 0.46.2+dfsg-3 282,5 кБ633,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 0.48.0+dfsg-4+b1 229,7 кБ1 050,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 0.46.2+dfsg-3 233,0 кБ644,0 кБ [списък на файловете]