Пакет: gromacs (2024.2-1 и други)

Връзки за gromacs

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник gromacs.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [www.gromacs.org]

Подобни пакети:

Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains variants both for execution on a single machine, and using the MPI interface across multiple machines.

Етикети: Field: Biology, Structural Biology, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::graphical, interface::x11, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Други пакети, свързани с gromacs

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: gromacs-data (= 2020.5-4) [alpha]

GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

dep: gromacs-data (= 2021.4-2) [hppa, m68k, sh4, x32]

dep: gromacs-data (= 2023.1-2) [ia64]

dep: gromacs-data (= 2024.1-1) [sparc64]

dep: gromacs-data (= 2024.2-1) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]
dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

dep: libc6 (>= 2.7) [hppa, m68k]
dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не hppa, ia64, m68k, sh4]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC support library
dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libgromacs5 (>= 2020.5) [alpha]

GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries
dep: libgromacs6 (>= 2021.4) [hppa, m68k, sh4, x32]

GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries
dep: libgromacs8 (>= 2023.1) [ia64]

GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries
dep: libgromacs9 (>= 2024.1) [sparc64]

GROMACS molecular dynamics sim, shared libraries

dep: libgromacs9 (>= 2024.2) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.5) [ia64]

high performance message passing library -- shared library
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [не alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

high performance message passing library -- shared library
dep: libstdc++6 (>= 11) [не alpha]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [alpha]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: libx11-6 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

X11 client-side library
dep: sse4.2-support [amd64, x32]

CPU feature checking - require SSE4.2

rec: cpp

GNU C preprocessor (cpp)
rec: mpi-default-bin [не alpha, hppa, m68k, sh4, x32]

Standard MPI runtime programs (metapackage)

sug: pymol

Molecular Graphics System

Изтегляне на gromacs

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2020.5-4	146,5 кБ	561,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2024.2-1	59,0 кБ	448,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2024.2-1	60,4 кБ	592,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	2021.4-2	148,0 кБ	512,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	2023.1-2	65,7 кБ	552,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	2021.4-2	134,9 кБ	554,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2024.2-1	59,5 кБ	608,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	2024.2-1	62,2 кБ	592,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2024.2-1	61,4 кБ	592,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2024.2-1	64,9 кБ	416,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2024.2-1	57,2 кБ	416,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	2021.4-2	158,4 кБ	484,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	2024.1-1+b1	59,0 кБ	4 189,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	2021.4-2	140,4 кБ	514,0 кБ	[списък на файловете]