Пакет: apbs (3.4.1-5.1 и други)

Връзки за apbs

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник apbs.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [www.poissonboltzmann.org]

Подобни пакети:

Adaptive Poisson Boltzmann Solver

APBS is a software package for the numerical solution of the Poisson-Boltzmann equation (PBE), one of the most popular continuum models for describing electrostatic interactions between molecular solutes in salty, aqueous media. Continuum electrostatics plays an important role in several areas of biomolecular simulation, including:

  * simulation of diffusional processes to determine ligand-protein and
    protein-protein binding kinetics,
  * implicit solvent molecular dynamics of biomolecules ,
  * solvation and binding energy calculations to determine
    ligand-protein and protein-protein equilibrium binding constants
    and aid in rational drug design,
  * and biomolecular titration studies.

APBS was designed to efficiently evaluate electrostatic properties for such simulations for a wide range of length scales to enable the investigation of molecules with tens to millions of atoms.

This package contains the apbs program and utilities.

Етикети: Field: Chemistry, Implemented in: C, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility

Други пакети, свързани с apbs

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: apbs-data (= 3.4.1-5.1)

data files for APBS (Adaptive Poisson Boltzmann Solver)
dep: libamd3 (>= 1:7.0.1)

approximate minimum degree ordering library for sparse matrices
dep: libapbs3t64 (= 3.4.1-5.1) [m68k, sh4]

Adaptive Poisson Boltzmann Solver

dep: libapbs3t64 (= 3.4.1-5.1+b1) [не m68k, sh4]
dep: libarpack2 (>= 2.1) [ia64]

Fortran77 subroutines to solve large scale eigenvalue problems
dep: libarpack2t64 (>= 2.1) [не ia64]

Fortran77 subroutines to solve large scale eigenvalue problems
dep: libblas3

Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

или libblas.so.3

виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcamd3 (>= 1:7.0.1)

symmetric approximate minimum degree library for sparse matrices
dep: libccolamd3 (>= 1:7.0.1)

constrained column approximate library for sparse matrices
dep: libcholmod5 (>= 1:7.3.1)

sparse Cholesky factorization library for sparse matrices
dep: libcolamd3 (>= 1:7.0.1)

column approximate minimum degree ordering library for sparse matrices
dep: libfetk1.9t64 (>= 3.4.1)

FETK libraries for APBS (shared libraries)
dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libjs-mathjax

JavaScript display engine for LaTeX and MathML
dep: libmaloc1 (>= 0.2-1)

Object-oriented Abstraction Layer for C
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

high performance message passing library -- shared library
dep: libspqr4 (>= 1:7.6.1+dfsg) [не sh4]

sparse QR factorization library

dep: libspqr4 (>= 1:7.7.0+dfsg) [sh4]
dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libsuitesparseconfig7 (>= 1:7.0.1)

configuration routines for all SuiteSparse modules
dep: libsuperlu6 (>= 6.0.1+dfsg1)

Direct solution of large, sparse systems of linear equations
dep: libumfpack6 (>= 1:7.0.1)

sparse LU factorization library

Изтегляне на apbs

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	3.4.1-5.1+b1	77,6 кБ	1 253,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	3.4.1-5.1+b1	76,5 кБ	369,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	3.4.1-5.1+b1	74,7 кБ	1 253,0 кБ	[списък на файловете]
armel	3.4.1-5.1+b1	75,8 кБ	315,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	3.4.1-5.1+b1	72,7 кБ	263,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	3.4.1-5.1+b1	80,1 кБ	305,0 кБ	[списък на файловете]
i386	3.4.1-5.1+b1	75,7 кБ	359,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	3.4.1-5.1+b1	88,2 кБ	384,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	3.4.1-5.1	75,3 кБ	314,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	3.4.1-5.1+b1	76,7 кБ	1 254,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	3.4.1-5.1+b1	81,9 кБ	1 253,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	3.4.1-5.1+b1	80,7 кБ	1 253,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	3.4.1-5.1+b1	76,8 кБ	309,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	3.4.1-5.1+b1	74,3 кБ	312,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	3.4.1-5.1	86,0 кБ	1 234,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	3.4.1-5.1+b1	82,2 кБ	18 538,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	3.4.1-5.1+b1	76,1 кБ	343,0 кБ	[списък на файловете]